己经退位的徳川秀忠和继位的第三代幕府将军徳川家光领伊达政宗等多位大名上洛，但并不是在皇宫去拜见后水尾天皇，而是让后水尾天皇和中宫德川和子以出巡的名议，下榻二条城，接受秀忠、家光的拜见，并升徳川家光为左大臣，以示天皇承认德川家光三代将军的地位。
如果说这些事免强都还能让皇室接受，但最过份的一次是在1629年，徳川家光打发自己的乳母阿福到京都参见后水尾天皇，按照礼仪，在日本只有五品以上的官员才有资格参见天皇的，阿福不仅没有官职，而且还只是一个乳母，当然这个阿福不是一般的乳母，而且一位有相份量的人，对徳川家光的影响力很大，但不管有多大份量，多大影响力，她还是一个乳母，居然也能参见天皇，自然被皇宫视为大辱，但迫于徳川氏的权力，后水尾天皇也不得不接见了阿福，并给她赐名春日局。
但就在那以后，后水尾天皇让位于德川和子所生的女儿兴子，也就是明正女天皇，自己来个眼不见为净，去当太上皇，后来明正女天皇又将皇位让给绍仁，也当了太上皇，而直到现在，后水尾天皇仍然还建在，实际在京都皇宫里养着两位太上皇。