防清军的进攻，并由李牟暂时兼任湖北省长，行使地方的行政权力，派来的行政官员也会马上到位，并且立刻开始组织百姓进行春耕，以及土地分配工作。
忠贞营整编的二个旅的番号为第三十旅，旅长李过、副旅长刘芳亮、参谋长刘汝魁，下辖两个团的团长为贺篮、田虎，属第七军编制；第三十一旅，旅长高一功，副旅长袁宗第、参谋长刘体纯，下辖两个团的团长为马重禧、张能，属第七军编制；其他降清反正的大顺军将领，如田见秀、张鼐、吴汝义、李友、李孜等人，根据这次功劳大小，授营连级军官的职务。而其余忠贞营的士兵也都重新编制，士兵及军官的待遇标准，也都按商家军的统一标准执行。
不过现在三十旅和三十一旅都还不能算是商家军正式的作战部队，因此暂时并不去其编属的军部报到，而是留在武昌府，和其他的新兵一起，接受训练，然后参加考核测试，合格之后，才能算是商家军的正式士兵，配发火枪等武器。
而忠贞营的家属也按先前说好，在武昌府内找地方安置下来，造籍登册，然后依据毎户人口的数量，分配给相应的土地，并发给种子、农具进行耕种。并同样享有鼓励耕种的减税政策。当然如果有人不想务衣，愿意经商、办厂、做工，也都悉听尊便，并按应分配的土地数量，补偿相应的白银。
李过、高一功、刘芳亮、袁宗第等忠贞营的诸将见商毅确实言而有信，尊守承诺，而且一切的侍遇也都依照商家军的条例，一视同仁，并无岐视，也就都放下心来，安心的留在武昌府，接受训练，争取早日通过考核，成为商家军的正式士兵。
而堵胤锡提出想和商毅面谈的要
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